Лукът се запържва с малко олио докато промени цвета си. Добавя се каймата и се разбърква. Поръсва се със сол, черен пипер, червен пипер и чубрица. 

Кубчетата бульон се разтварят във вода. След като сместа заври, постепенно се изсипва кус куса. Вари се до омекване и след това се прецежда. Кус кусът се връща обратно в тенджерата.

В отделен съд се запържва маслото, добавя се и червения пипер. Запръжката се изсипва при кус куса.

В намазнена тава се слага половимата количество кус кус. Отгоре се добавя каймата, като се заравнява с леко притискане. Отгоре се изсипва останалия кус кус.

Заливката се приготвя като в купа се разбъркват яйцата и постепенно се смесват с прясното мляко. Посолява се, прибавя се сиренето и мусаката се залива. Пече се в умерено затоплена фурна на 180 градуса за 20-30 минути.

Готовото ястие се оставя да престои 5-10 минути, след което се нарязва на порции.